Кафедра биоинформатики и математической биологии

Описание кафедры

Кафедра биоинформатики и математической биологии СПбАУ РАН им. Ж. И. Алферова — это форпост научной аналитики, где гигабайты данных превращаются в прорывные биомедицинские открытия. Здесь мощные GPU-кластеры и облачные платформы обрабатывают пета- и эксабайты геномных, протеомных и клинических данных, а студенты и исследователи создают интеллектуальные системы на основе машинного и глубокого обучения для диагностики, прогноза и персонализированной терапии.

Каждый проект начинается с реальных задач: от выявления скрытых паттернов в медицинских ЭР-картах до предсказания мутаций, ответственных за резистентность опухолей. Используя конвейеры Big Data и инструменты для визуализации многомерных биомаркеров, вы научитесь строить нейронные сети для сегментации изображений МРТ, разрабатывать алгоритмы анализа single-cell RNA-seq и внедрять решения на стыке биологии, медицины и искусственного интеллекта.

Под руководством экспертов в области биостатистики, компьютерного зрения и NLP вы не просто изучите Python, R и TensorFlow — вы получите опыт End-to-End разработки решений от ETL-пайплайнов до настройки моделей в продакшене биомедицинских данных.

Если ваша цель — создавать AI-решения, способные спасти жизни и открыть новые горизонты науки, добро пожаловать на кафедру, где большие данные встречаются с большими идеями.

Мотивационный слоган:

Разгадывай коды жизни с AI – стань архитектором медицины будущего! В стенах нашей кафедры каждый проект — билет в будущее: здесь создают мобильные приложения для персонализированной медицины, разрабатывают алгоритмы ранней диагностики рака и моделируют пути распространения вирусов. Если ты хочешь стать архитектором живых систем и освоить стиль жизни «наука 24/7», присоединяйся к нам — и вместе мы проложим дорогу к биологической революции!

КАК ПОСТУПИТЬ?

  • Направления обучения

    Кафедра биоинформатики и математической биологии ведет подготовку специалистов всех трех ступеней обучения:

    Бакалавриат

    Профиль «Биоинформатика» (направление 03.03.01 – «Прикладные математика и физика»)

    Профиль «Цифровая физика»

    Магистратура

    Профиль «Алгоритмическая биоинформатика» (направление 03.04.01 – «Прикладные математика и физика»)

    Аспирантура

    Профиль «Математическая логика, алгебра и теория чисел» (направление 01.06.01 – «Математика и механика»

    Профиль «Теоретические основы информатики» (направление 09.06.01 – «Информатика и вычислительная техника»)

  • Базовые курсы

    Профиль «Биоинформатика» — это твой трамплин в мир прорывных алгоритмов и софта на стыке математики, физики, химии и биологии: здесь ты научишься глубоко анализировать геномные, протеомные, транскриптомные и метаболомные данные, прокачаешь системную и структурную биологию, биотехнологии и биостатистику, а за каждым спецкурсом стоят приглашённые эксперты, готовые раскрыть секреты реальных научных кейсов.

    Цифровая физика превращает вас в архитектора виртуальных экспериментов: вы объединяете продвинутую математику, машинное обучение и супервычисления на GPU- и CPU-кластерах, чтобы конструировать цифровые двойники физических процессов, обрабатывать терабайты экспериментальных данных и создавать собственные инструменты для высокопроизводительных расчётов в физике, биологии и биофизике — от прогнозирования свойств новых молекул до моделирования молекулярных механизмов жизни.

    Подробнее об образовательных программах
  • Трудоустройство

    Выпускники кафедры биоинформатики и математической биологии СПбАУ РАН им. Ж.И. Алферова становятся драйверами научных и технологических стартапов в сфере цифровой медицины и фармацевтики, возглавляют отделы биоинформатики в крупных биотех- и фармакомпаниях (BIOCAD, R-Pharm), внедряют AI- и Big Data-конвейеры в медицинских лабораториях и клиниках, работают в научных институтах РАН и ведущих университетах как разработчики алгоритмов анализа «омиксных» и клинических данных, а также становятся ценными аналитиками и инженерами в IT-платформах (Yandex Data Factory, СберAI), преобразуя пета- и эксабайты био- и медицинской информации в прорывные персонализированные решения.

  • Профессорско-преподавательский состав
    Давыдов Роман Вадимович

    Должность:
    заведующий кафедрой, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат физико-математических наук

    Преподаваемые дисциплины:
    Численные методы, гр. 202, 401

    Андреев Юрий Александрович

    Должность:
    преподаватель, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Преподаваемые дисциплины:
    Машинное и глубинное обучение, Обучение с подкреплением, Анализ изображений.

    Евсюков Игорь Валерьевич

    Должность:
    старший преподаватель, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Преподаваемые дисциплины:
    Введение в биоинформатику, Биоинформатика рака

    Зайцева Анна Юрьевна

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат физико-математических наук

    Преподаваемые дисциплины:
    Сенсорные системы для медико-биологических исследований, гр. 604

    Крашенинников Сергей Вениаминович

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат физико-математических наук

    Учёное звание:
    Старший научный сотрудник

    Преподаваемые дисциплины:
    Операционная система Unix (лекции и практика), C и C++, Программирование для WEB, Параллельное программирование, гр. 102, 202, 302

    Степанова Анастасия Борисовна

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат биологических наук

    Учёное звание:
    доцент

    Преподаваемые дисциплины:
    Экобезопасность при проведении исследований в области БИ и БТ, методология СБ

    Устинов Александр Борисович

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:

    Учёное звание:

    Преподаваемые дисциплины:
    Python (лекция и практика), Разработка пользовательского интерфейса, гр. 101, 102, 302